Nel 2009 la Confederazione svizzera incarica l’equipe di progettazione, diretta da P&B Partner Architekten di Winterthur, di procedere a una seconda fase di ristrutturazione. L’obiettivo principale di questa successiva serie d’interventi consiste nel perfezionare le tecniche museali, gli spazi adibiti alle attività didattiche e l’infrastruttura del ristorante. Tali lavori vengono condotti nel massimo rispetto dell’architettura originaria e della storicità del luogo.