En 2009, la Confédération suisse charge l’équipe de planification dirigée par P & B Partner Architekten, à Winterthour, d’une seconde phase de rénovation. L’objectif principal de cette deuxième série de travaux consiste à perfectionner les techniques muséales, les espaces réservés aux activités pédagogiques, et l’infrastructure du restaurant. Toutes ces interventions sont menées avec une conscience aiguë de l’architecture d’origine et de l’historicité du lieu.